Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa11P50709 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms