Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmod1P49813 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Tmod1P49813 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Tmod1P49813 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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Tmod1P49813 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Tmod1P49813 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmod1P49813 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms