Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TfamP40630 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TfamP40630 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TfamP40630 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TfamP40630 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TfamP40630 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TfamP40630 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TfamP40630 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TfamP40630 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TfamP40630 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TfamP40630 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TfamP40630 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TfamP40630 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TfamP40630 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms