Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lama1P19137 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lama1P19137 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lama1P19137 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lama1P19137 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.9 ms