Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chil3O35744 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chil3O35744 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chil3O35744 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms