Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisa8J3QNX5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa8J3QNX5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms