Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200cJ3QK46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms