Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pm20d2A3KG59 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms