Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms