Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapbQ9QY76 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms