Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Cldn19Q9ET38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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Cldn19Q9ET38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Cldn19Q9ET38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Cldn19Q9ET38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Cldn19Q9ET38 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn19Q9ET38 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Cldn19Q9ET38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Cldn19Q9ET38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Cldn19Q9ET38 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Cldn19Q9ET38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Cldn19Q9ET38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn19Q9ET38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.9 ms