Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr1Q9EPQ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tlr1Q9EPQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr1Q9EPQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms