Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm5Q9D806 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms