Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem30cQ9D4D7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem30cQ9D4D7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms