Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim3Q99PE5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms