Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tsnaxip1Q99P25 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tsnaxip1Q99P25 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms