Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtpbp4Q99ME9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp4Q99ME9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms