Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krcc1Q99JT5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krcc1Q99JT5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms