Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep2Q8VCD6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep2Q8VCD6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms