Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Commd9Q8K2Q0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd9Q8K2Q0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms