Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrit1Q8K099 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrit1Q8K099 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrit1Q8K099 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms