Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad2Q8CDM1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms