Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alx1Q8C8B0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx1Q8C8B0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms