Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubqln3Q8C5U9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.6 ms