Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem260Q8BMD6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem260Q8BMD6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms