Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic3Q62521 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic3Q62521 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic3Q62521 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms