Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mre11Q61216 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms