Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctf1Q60753 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctf1Q60753 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms