Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 994 ms