Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228bQ497Q6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms