Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uspl1Q3ULM6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uspl1Q3ULM6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms