Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nkx6-3Q3UHX8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Nkx6-3Q3UHX8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Nkx6-3Q3UHX8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkx6-3Q3UHX8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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