Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctu2Q3U308 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms