Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TchpQ3TVW5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TchpQ3TVW5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 983.5 ms