Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CiartQ3TQ03 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CiartQ3TQ03 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms