Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MitfQ08874 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms