Protein–RNA interactions for Protein: P97367

Meis2, Homeobox protein Meis2, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis2P97367 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis2P97367 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis2P97367 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis2P97367 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis2P97367 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis2P97367 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Meis2P97367 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Meis2P97367 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis2P97367 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Meis2P97367 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis2P97367 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis2P97367 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis2P97367 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis2P97367 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis2P97367 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis2P97367 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis2P97367 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis2P97367 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis2P97367 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis2P97367 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms