Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgd1P52734 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgd1P52734 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms