Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox2P48432 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox2P48432 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox2P48432 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms