Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem200cJ3QK46 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms