Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms