Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brpf1B2RRD7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brpf1B2RRD7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brpf1B2RRD7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms