Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx6Q9R1R0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhx6Q9R1R0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhx6Q9R1R0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms