Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms