Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4bQ9ES61 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a4bQ9ES61 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms