Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SgshQ9EQ08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms