Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc46a3Q9DC26 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms