Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrpraQ9DBG7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms