Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt34Q9D646 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt34Q9D646 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms