Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spns3Q9D232 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spns3Q9D232 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms